Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKAP1Q86WV1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms