Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms