Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms