Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP53Q70EK8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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