Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms