Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MLIPQ5VWP3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MLIPQ5VWP3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MLIPQ5VWP3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MLIPQ5VWP3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MLIPQ5VWP3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MLIPQ5VWP3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms