Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM208BQ5VWN6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms