Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP9Q5VTM2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms