Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms