Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms