Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-2Q52LG2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms