Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A12Q504Y0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms