Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms