Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms