Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms