Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CCDC96Q2M329 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CCDC96Q2M329 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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CCDC96Q2M329 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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