Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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