Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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