Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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DDB1Q16531 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDB1Q16531 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms