Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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