Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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