Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms