Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SIX1Q15475 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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SIX1Q15475 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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SIX1Q15475 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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