Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3GAP1Q15042 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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