Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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