Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms