Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MELKQ14680 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MELKQ14680 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MELKQ14680 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms