Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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KRT33BQ14525 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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KRT33BQ14525 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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KRT33BQ14525 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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KRT33BQ14525 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT33BQ14525 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms