Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms