Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms