Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms