Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms