Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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