Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms