Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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