Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms