Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PUDPQ08623 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PUDPQ08623 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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