Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms