Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOX4Q06945 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms