Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms