Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APBA1Q02410 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APBA1Q02410 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms