Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms