Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms