Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAE1P78406 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms