Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms