Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P63121 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms