Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms