Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms