Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPAP53621 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPAP53621 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPAP53621 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms