Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGDP52209 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGDP52209 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms